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寡核苷酸药物迭代不止,前处理平台如何一招应万变?

更新时间:2026-03-06点击次数:33

过去十年,寡核苷酸药物的结构改性从未停止:从全磷硫化(PS)修饰ASO,到2'-OMe、2'-MOE修饰,再到如今大热的GalNAc-siRNA、脂质共轭siRNA…每一代新分子的出现,都在考验同一个问题:


你上一个项目的前处理方法,还能用在这个新分子上吗?


传统LLE + SPE(IPC)两步法的局限

目前许多实验室采用液液萃取(LLE)+ 离子对反相SPE处理体内寡核苷酸样品。流程看似成熟,但存在以下深层局限:


LLE溶剂操作挑战

LLE常用萃取溶剂(MTBE、乙酸乙酯、正己烷、1-氯丁烷乃至苯酚-氯仿体系)毒性强、气味大,对通风条件和操作规范要求高,高通量样品处理时实际操作挑战不容忽视。


两步操作,耗时耗力,误差叠加

LLE界面乳化、转移损失不可避免,SPE上样又是一次回收率关卡,两步误差叠加,批间CV难以压低,ICH M10合规压力大。


上样量大,基质干扰难以控制

当体内浓度低(ng/mL甚至pg/mL级),需大体积血浆上样(≥500 µL)。SPE对目标物的选择性不足,会造成基质效应过大,抑制目标药物信号。


选择性依赖离子对试剂,随改性漂移

SPE依赖TEA等外加试剂与磷酸骨架形成离子对,这一相互作用对分子结构高度敏感——链长、PS比例、GalNAc或脂质共轭改变,保留因子随之漂移,oligo药物变了,方法可能需重新优化。


OTX:机制不同,逻辑才真正不同

Clarity OTX采用混合模式阴离子交换(Mixed-Mode Anion Exchange)SPE填料,结合专有配方缓冲液体系,从保留机制上与传统反相SPE根本不同:

  • 阴离子交换模式与寡核苷酸磷酸骨架产生特异性相互作用。磷酸骨架是所有寡核苷酸的共有结构特征,不随改性类型变化——这是一个稳定的选择性"锚点",赋予OTX对不同改性分子的广谱适应性。

  • 混合模式协同作用进一步提升基质净化能力,通过洗涤条件的灵活调节,可有效去除盐类、糖类、大分子蛋白及基因组DNA等内源性干扰,回收率稳定达80%以上。

  • 单步SPE,无需前置LLE,流程缩短,误差来源减少。

更高的选择性意味着基质更干净、基线更低、信噪比更优,可显著缩减所需上样体积——这对珍贵的动物样品尤其重要。

Oligo药物的修饰变了,不需要推倒重建方法逻辑,只需在已有框架内微调洗涤条件。


飞诺美技术团队针对OTX在各种oligo药物的提取净化上已积累了丰富的经验。


多种寡核苷酸同时定量 / 小鼠肝脏


在同一OTX方法框架下,对Fomivirsen(全PS ASO)、Givosiran(已上市GalNAc-siRNA)及一种处于临床研究阶段的siRNA,共5条链进行同时提取与定量。


分析物

分子类型

肝脏回收率

RSD

Givosiran 正义链

GalNAc-siRNA

118.8%

5.7%

Givosiran 反义链

GalNAc-siRNA

105.9%

2.6%

研究siRNA 反义链

siRNA(临床研究阶段)

118.6%

4.0%

研究siRNA 正义链

siRNA(临床研究阶段)

118.6%

7.0%

Fomivirsen

全PS ASO

89.0%

1.0%




全部分析物回收率89-119%,RSD≤7%。


全PS修饰2'-MOE Gapmer /

CNS组织(脑+脊髓)


Clarity OTX(100 mg/well),Proteinase K预处理后,脑组织标准曲线accuracy 93-110%,CV<11%,LLOQ 1 ng/mL。图为添加内标后,目标oligo 在三个QC浓度下的总离子流色谱图,内标重现性和QC回收率均表现良好。

寡核苷酸药物迭代不止,前处理平台如何一招应万变?


GalNAc-siRNA(Inclisiran)/

小鼠血浆 & 肝脏(高灵敏度方案)

采用Clarity OTX(100 mg/well)对Inclisiran进行小鼠血浆及肝脏样品提取,以Fomivirsen为内标,血浆LLOQ低至0.2 ng/mL,肝脏LLOQ低至1 ng/mL,较传统LLE+SPE方法灵敏度提升10-20倍,且不同操作人员间重现性良好,方法稳健性突出。(图为Inclisiran SS和AS链在小鼠血浆基质中的线性结果)

寡核苷酸药物迭代不止,前处理平台如何一招应万变?
寡核苷酸药物迭代不止,前处理平台如何一招应万变?


同一平台,血浆到脑组织,ASO到GalNAc-siRNA,单一分析物到多组分同时定量——方法框架不变,参数按需微调。


产品规格,覆盖不同需求

产品规格

适用场景

Clarity OTX 2 mg/well 96孔板

超低LLOQ,微洗脱富集

Clarity OTX 10 mg/well 96孔板

小体积血浆/血清体内PK研究

Clarity OTX 25/50/100 mg/well

96孔板

较大体积上样,血浆和组织提取

Clarity OTX 100/500 mg管式

方法开发,小批量样品




一对一技术支持

我们根据您的寡核苷酸结构(改性类型、链长、共轭系统)、目标浓度范围及生物基质类型,提供针对性的 Starting SOP,涵盖样品前处理、SPE条件优化、LC-MS参数建议,支持从方法开发到ICH M10合规验证全流程。

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