【热点分享】药物在“卷创新”，色谱柱在“卷性能”

更新时间：2026-05-09

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多肽药物领域

(Peptides)

文献标题:

Yeast Display Technology Enables Rapid Discovery of Low-Nanomolar Macrocyclic Peptide Inhibitors of Human Angiotensin-Converting Enzyme 2

doi.org/10.1021/acs.jmedchem.5c02876

药物类型: 多肽 (大环多肽 Macrocyclic Peptides)

文献概述：大环肽（MPs）是连接小分子和生物大分子的理想药物形式。为了克服传统体外筛选技术（如噬菌体展示）盲目且无法实时监控的局限，该研究成功应用了酵母表面展示技术结合荧光激活细胞分选（FACS），实现了对数百万种结构多样的二硫键环化肽库的高通量、定量筛选。该研究有力证明了酵母展示技术是一种高效、直观且可靠的药物发现平台。它能够快速生成具有较高亲和力、独特结合模式和理想药理特性的大环肽，为未来靶向潜在疗法的开发提供了强的技术支撑。

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Aeris^™ 3.6 µm PEPTIDE XB-C18 (250 x 4.6 mm, 100Å) [分析型]

Luna^® 5 µm C18(2) (250 x 21.2 mm, 100Å) [制备型]

具体应用场景：

制备柱: 用于通过固相肽合成(SPPS)后的大环多肽粗品的大规模分离与纯化。

分析柱:用于多肽最终产物的LC-MS纯度鉴定（要求纯度 >95%）及异构体的高效分离。

寡核苷酸药物领域

(Oligonucleotides / Oligo)

文献标题:

Differential Protein Precipitation-Based GalNAc-siRNA Sample Preparation with LC/MS Method Development Workflow in Plasma

doi.org/10.1021/acs.analchem.5c01587

药物类型：寡核苷酸 (GalNAc-siRNA 偶联药物，如 Givosiran、Lumasiran 等)

文献概述：该研究开发了一种新型差速蛋白沉淀法，专用于血浆基质中 GalNAc-siRNA 偶联药物的 LC/MS 生物分析。为克服传统固相萃取（SPE）回收率不稳及杂交法受限于特异性试剂的痛点，该方案通过优化的有机溶剂组合，高效去除高丰度大分子蛋白并精准保留目标 siRNA。结合分离色谱柱与高分辨 Orbitrap / QTRAP 质谱，成功实现了对四种 FDA 获批药物（如 Givosiran、Lumasiran、Inclisiran、Vutrisiran）及其主要代谢物的高灵敏定量，定量下限（LLOQ）低至个位数 ng/mL 级别。该方法在大鼠体内药代动力学（PK）研究中被成功验证，凭借其操作简便、成本低、稳健性强等优势，为克服常规分析中极易产生的非特异性吸附问题、提升分析通量提供了一种突破性的标准化工作流。

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Phenomenex色谱柱型号及规格：

Biozen^™ 2.6 µm Oligo (50 x 2.1 mm)

Clarity 3 µm Oligo-RP C18 (50 x 10 mm)

具体应用场景：

制备柱：生物分析与药代动力学(PK)研究: 结合高分辨 Orbitrap 和 QTRAP 质谱，对动物及人体血浆样本中的多种 FDA 批准的 GalNAc-siRNA 及其主要代谢产物进行同时定量分析。

复杂的 siRNA 极易产生非特异性吸附：且前处理繁琐。研究采用高效的差速蛋白沉淀法，配合 Biozen Oligo 核壳柱与生物惰性 (BioTi^™) 硬件，在 LC-MS/MS 分析中展现了较佳的峰形与超高灵敏度，克服了常规分析通量低及灵敏度不足的痛点。

抗体偶联药物载荷领域

(ADC Payload)

文献标题:

Development and validation of an efficient and sensitive LC-MS/MS assay for simultaneous determination of the high frequency used antibody drug conjugate payload MMAE and anti-vascular tyrosine kinase inhibitor lenvatinib in human plasma

doi.org/10.1016/j.jpba.2026.117435

药物类型：抗体偶联药物载荷 (MMAE) 与靶向小分子 (Lenvatinib) 联合用药

文献概述：当前肿瘤临床治疗中，ADC 药物（携带 MMAE 毒素）与抗血管生成小分子（如仑伐替尼 Lenvatinib）的联合用药（Combo Therapy）正成为前沿趋势。同时监测极低浓度的游离高活毒素（MMAE）和共给药的 TKI 小分子带来了极大的分析挑战。该研究成功开发并验证了一种高灵敏度的 LC-MS/MS 方法，可在人体血浆中同时定量这两种物质，有效克服了血浆内源性基质的严重干扰，实现了极性差异显著的两种药物的高效、基线分离，为联合疗法的临床 PK 及安全性评估提供了关键的数据支撑。

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Phenomenex色谱柱型号及规格：

Kinetex^® 2.6 µm PFP 或 XB-C18 (50 x 2.1 mm, 100Å)

具体应用场景：

复杂血浆基质中 ADC 游离高活毒（MMAE）与共给药的抗血管生成小分子（仑伐替尼）的 LC-MS/MS 同步临床定量与动态监控。

文献标题:

Synthesis of integrin-targeting pro-drugs for the selective release of anti-tumor agents

air.unimi.it/retrieve/handle/2434/584099/1054688/phd_unimi_R11168.pdf#page=63.08

药物类型：肿瘤靶向前体药物/偶联物载荷 (含 MMAE/MMAF 毒素及多肽类 Linker 偶联物)

文献概述：该研究聚焦新型肿瘤靶向药物及 ADC 载荷的开发，详细阐述了高活毒素单甲基奥瑞他汀E（MMAE）与复杂可裂解多肽连接子（如 cyclo[DKP-RGD]-β-glucuronide）的化学偶联全过程。由于反应粗品中往往混有大量结构相似的异构体副产物及剧毒游离小分子，分离难度极大。研究团队依托反相制备对目标高活毒素偶联物进行纯化。该工艺成功清除了所有关键杂质，最终获取了纯度较高的 Linker-Payload 目标分子，为后续靶向给药系统在体内的生物学评价奠定了坚实的物质基础。

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Luna^® 10 µm C-18(2) (250 × 21.2 mm, 100Å)

具体应用场景：

用于将高活毒素 MMAE 与多肽/葡糖醛酸苷（glucuronide）连接子进行复杂化学偶联后，对目标 Linker-Payload 偶联物粗品进行半制备/制备分离。

DNA编码化合物库领域

(DEL)

【DEL 质谱表征与 DNA 标签机制研究】

文献标题:

Advanced Mass Spectrometry Strategies for Deciphering Structural and Functional Aspects of Biomolecular Complexes

doi.org/10.3929/ethz-c-000789649

药物类型：DNA编码化合物库 (带有单链/双链 DNA 标签的配体)

文献概述：该顶尖质谱研究深入探讨了 DNA 标签对小分子配体结合亲和力的影响。在分析带有单链或双链 DNA 的复杂极性复合物时，常规 C18 柱难以保留。借助极性改性色谱柱（如 Luna Omega Polar C18），研究人员在质谱前端实现了强极性 DNA-配体复合物的高效保留与分离，为后续靶点亲和力质谱测定奠定了基础。

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Luna^® Omega 1.6 µm Polar C18 (50 x 2.1 mm, 100Å) / Kinetex^® 核壳柱

具体应用场景：

针对带有强极性大分子 DNA 标签的 DEL 库分子，进行高分辨率的 LC-MS/MS 结构表征及结合亲和力分析。

【从 DEL 筛选到高潜力候选药物的转化与合成】

文献标题:

1. From DNA-Encoded Library Screening to AM-9747: An MTA-Cooperative PRMT5 Inhibitor with Potent Oral In Vivo Efficacy (J. Med. Chem., 2025)

doi.org/10.1021/acs.jmedchem.4c03101

2. DNA-encoded library screening uncovers potent DNMT2 inhibitors targeting a cryptic allosteric binding site (iScience, 2025)

doi.org/10.1016/j.isci.2025.113300

药物类型：DEL 筛选衍生的新型变构抑制剂 (PRMT5 抑制剂 AM-9747 及 DNMT2 抑制剂)

文献概述：近年 DEL 筛选展现出强的成药转化力。不论是发现靶向 PRMT5 的协同抑制剂 AM-9747，还是揭示 DNMT2 的隐秘变构结合口袋，在脱离 DNA 标签后的实际化学合成验证阶段，研发团队均高度依赖高载量制备柱来处理复杂的多步合成中间体，确保最终供动物模型（In vivo）测试的小分子化合物纯度。

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Gemini^® NX-C18 及 Luna^® C18(2) [半制备/制备级柱]

具体应用场景：

DEL筛选出苗头化合物后，在“Hit-to-Lead"先导化合物优化阶段，对复杂结构（如新型大环或多环芳烃修饰体系）进行制备纯化。

分子胶与靶向蛋白降解领域

(Molecular Glues & TPD)

【分子胶的高通量筛选与化学蛋白质组学分析】

文献标题:

An engineered cereblon optimized for high-throughput screening and molecular glue discovery

doi.org/10.1016/j.chembiol.2024.11.002

药物类型：分子胶降解剂 (CRBN 调节剂, IMID 化合物库)

文献概述：由于天然 CRBN 蛋白的复杂性，分子胶的发现长期受限。该研究设计了易于表达的 CRBN_ΔHBD 结构，并对含有三千多种化合物的 IMID 库进行了高通量筛选。在此类依赖较高灵敏度 LC-MS 的化学蛋白质组学工作流中，超高柱效在纳升液相（nano-LC）或Nano液相系统上，能精准分离酶解后的复杂多肽混合物，帮助鉴定了包括 IKZF1 在内的多个分子胶潜在降解底物。

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Biozen^™ 2.6 µm Peptide / Kinetex^® 1.7 µm C18

具体应用场景：

利用化学蛋白质组学（Chemo-proteomics），在进行三元复合物（Ternary complex）互作组库（Interactome）和降解组库（Degradome）分析时的高分辨 LC-MS/MS 肽段分析。

【共价变构分子胶的体内代谢】

文献标题:

A covalent allosteric molecular glue suppresses NRF2-dependent cancer growth

doi.org/10.1158/2159-8290.CD-25-1187

药物类型：共价变构分子胶 (Covalent allosteric molecular glue - VVD-065)

文献概述：该文献披露了 First-in-class 共价变构分子胶 VVD-065 的发现过程。它能强效抑制 NRF2 依赖的肿瘤生长（如食管鳞癌和非小细胞肺癌）。在推动此类高度创新的共价分子进入临床前测试阶段时，测试了分析柱（如Kinetex）支持血药浓度检测及与顺铂（Cisplatin）联用时的药物相互作用监测；反相制备柱（如Luna）则保障了大量供动物体内实验（In vivo）使用的高纯度化合物合成后的分离。

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Phenomenex色谱柱型号及规格：

Kinetex^® 2.6 µm XB-C18

Luna^® 5 µm C18(2) / Gemini

具体应用场景：

新型共价分子胶 (VVD-065) 体内抗肿瘤试验（In vivo efficacy）中的血浆药代动力学 LC-MS 监控，及其原料分子的制备分离。

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1.Yeast Display Technology Enables Rapid Discovery of Low-Nanomolar Macrocyclic Peptide Inhibitors of Human Angiotensin-Converting Enzyme 2.

2.Differential Protein Precipitation-Based GalNAc-siRNA Sample Preparation with LC/MS Method Development Workflow in Plasma.

3.Development and validation of an efficient and sensitive LC-MS/MS assay for simultaneous determination of the high frequency used antibody drug conjugate payload MMAE and anti-vascular tyrosine kinase inhibitor lenvatinib in human plasma.

4.Synthesis of integrin-targeting pro-drugs for the selective release of anti-tumor agents.

5.Advanced Mass Spectrometry Strategies for Deciphering Structural and Functional Aspects of Biomolecular Complexes.

6.From DNA-Encoded Library Screening to AM-9747: An MTA-Cooperative PRMT5 Inhibitor with Potent Oral In Vivo Efficacy (J. Med. Chem., 2025).

7.DNA-encoded library screening uncovers potent DNMT2 inhibitors targeting a cryptic allosteric binding site (iScience, 2025).

8.An engineered cereblon optimized for high-throughput screening and molecular glue discovery.

9.A covalent allosteric molecular glue suppresses NRF2-dependent cancer growth.

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